La fondation de Merry-la-Vallée remonte à l'époque gallo-romaine.

On y exploitait fer et bois, une activité qui donnera les noms successifs de la commune

: Matricus,

Matriacum in Valle en 1221;

 Merri en 1289 ;

Merriacus,

Merry-les-Egleny en 1300

 jusqu'à la Révolution, Merry-Valles (vallées du Vrin de l'Ocre et de l'Ouanne);

 Merry-Vaux

et enfin, Merry-la-Vallée au milieu du XIXe siècle.

Le nom Merry vient vraisemblablement de la fabrication de merrains, des planches fendues du centre vers l'extérieur du tronc des chênes qui servent à la fabrication des tonneaux.